События игры assasins creed 2 происходят после окончания первой части, где, в 2012-м году, Дезмонд Майлс (Нолан Норт) являющийся пленником «Абстерго Индастриз», которые держат его для дешифровки подсознательной памяти о его предке-убийце Альтаире в машине «Анимус». «Абстерго», являющиеся современными аналогами рыцарей Тамплиеров, использовали Дезмонда, чтобы узнать местонахождение могучего артефакта, называемого «Частицей Эдема». Используя зрение орла, преобретенного в результате «эффекта просачивания» (из-за долгого нахождения в Анимусе), Дезмонд начал различать сообщения и символику, написанную кровью на его стене спальни предыдущим подопытным, именуемым «Объект 16».
